Los colores del club, amarillo y azul a rayas verticales, fueron escogidos en referencia a los matices de los toldos que cubrían los negocios comerciales de los barrios en la época. El primer equipo del Bohemio debutó oficialmente en torneos de AFA derrotando a Racing Club B el 22 de abril de 1906. En 1931 fue uno de los clubes que participaron del primer torneo de fútbol profesional en la Argentina. En 1960 ganó la Copa Suecia, convirtiéndose en el primer equipo fuera de los denominados grandes en obtener un torneo profesional de AFA. El mismo año, el club inauguró su nuevo estadio, que desde 2000 se denomina León Kolbowski, en honor al presidente que lo construyó. A lo largo de su historia, Atlanta jugó 64 temporadas en la primera división y 43 en torneos de Ascenso y aportó 20 futbolistas a la Selección Argentina. A pesar de no jugar en Primera División desde el año 1984, el Bohemio se mantiene en los 20 primeros puestos de la tabla histórica del fútbol profesional en Argentina (1931-2012). Si bien su actividad principal es el fútbol, el club posee varias secciones deportivas (futsal, baby fútbol, karate, boxeo, taekwondo, patín, handball) y el Centro Cultural Osvaldo Miranda, que brinda cursos y actividades como teatro, ajedrez, danza, canto, aprendizaje de instrumentos y de idioma inglés.
